A jogabilidade baseada em física do single-player Run and Gun Game Intrusion 2 é uma reminiscência dos dias de 16 bits. O jogo apresenta animação processual e inimigos ragdoll. A jogabilidade é movimentada e cheia de momentos frenéticos. Situado em um planeta coberto de gelo, este platformer de ação atrairá os jogadores de todas as idades. Embora possa parecer um pouco semelhante ao Slug de Metal, este é, na verdade, um dos atiradores mais originais do tipo.
A jogabilidade é a mesma que a intrusão original, com a única grande diferença sendo que o jogo é baseado em um jogo flash, e os gráficos são melhores do que qualquer coisa encontrada em muitos jogos de arcade do Xbox Live. Os jogadores podem escolher entre uma grande variedade de armas e assumir uma variedade de inimigos. As músicas e obras de arte dos jogos também são impressionantes, assim como o design do nível. Embora os gráficos não sejam tão impressionantes quanto o original, é definitivamente uma melhoria sobre a versão anterior.
Os encontros do chefe dos jogos são um destaque real. O combate é uma reminiscência de jogos clássicos de 16 bits, e cada chefe tem várias fases diferentes. A física e a jogabilidade são apertadas, e a variedade de armas dá aos jogadores uma experiência única. Apesar da música repetitiva e do comprimento curto, o jogo oferece um desafio incrivelmente alto. O chefe final é talvez o mais memorável e difícil que o chefe encontre no jogo. O jogador deve se esquivar de mísseis enquanto eles explodem o inimigo de baixo.